Автоматизированная обработка и аннотирование данных NGS
Профессиональное программное обеспечение для биоинформатики, которым могут пользоваться неспециалисты
Биоинформатика никогда не была такой простой
Преимущества NGS Wizard
Возможность установки программного комплекса на серверах клиента
Программой можно пользоваться через обычный интернет-браузер. Данные не будут покидать организацию клиента, они хранятся на внутренних серверах организации (и/или на серверах в т.ч. сертифицированных на территории России).
Мультиплатформенность
NGS Wizard не привязан к отдельному секвенатору, и будет обрабатывать данные разных платформ: Illumina, Oxford Nanopore, Ion Torrent, SeqLL, BGI. Распознавание платформы и типов данных будет автоматическим.
Ускорение и обучение
Благодаря NGS Wizard можно сократить время на техническую обработку данных в несколько раз. Программа предлагает широкий инструментарий профессиональным биоинформатикам с возможностью поэтапно отследить весь процесс анализа и произвести анализ по своему пайплайну.
Глубокая автоматизация
На основе специальных разработанных нами AI-алгоритмов. Программой могут пользоваться люди без специальных знаний в техническом анализе геномных данных - врачи, ученые, био-инженеры и даже обычные граждане.
Специализированные отчеты в один клик
Отчеты показывают клинически значимые варианты для заданной нозологии и случайные находки по другим нозологиям; таргетные препараты категории A, B, а так же C, D, E; частоты мутаций из внутренней базы данных и ошибки серийных эффектов; рекомендуемые уточнения диагноза на основе паттерна мутаций; мутационную нагрузку (для опухолей) и многое другое.
Эксклюзивная база GWAS-MAP о связи мутаций человека с фенотипическими признаками
База GWAS-MAP агрегирует все качественные полногеномные исследования ассоциаций. База позволяет иметь доступ к актуальной информации о степени влияния генов конкретного человека на персональные риски заболеваний.
В разработке
Интерфейс NGS Wizard
Удобный интерфейс позволяет видеть полную картину по пациентам и их данным в любом web-браузере
Современные проверенные инструменты позволяют искать точечные мутации, короткие инделы, изменения числа копий и структурные вариации для опухолевых и наследственных образцов
Специальный инструмент позволяет удобно фильтровать и приоритизировать найденные варианты и аннотировать их большим количеством информации из профессиональных баз данных.
Интерпретацию варианта можно проводить прямо в приложении, оценивая все необходимые факты, включая критерии ACMG, в одном окне и создавая собственные комментарии к вариантам
Все аннотации статей из PubMed и Google Scholar мгновенно подгружаются для конкретного варианта. Создавайте собственную библиотеку из статей и цитат
Отчеты для врачей позволяют получить развернутую и краткую генетическую картину патологии, включающую варианты с высокой клинической значимостью, рекомендуемые препараты и ссылки на клинические исследования
Специальный модуль для пренатального генетического тестирования позволяет определять анеуплоидии и получать наглядный отчет
Создавайте собственную базу генетических находок, аннотируйте каждого пациента любой собственной информацией
Сферы применения NGS Wizard
Базовая функциональность
Позволяет находить мутации и геномные полиморфизмы и аннотировать их с помощью подключенных баз данных для научных исследований.
Пользователи – BioTech-компании, академические организации, организации экспериментальной медицины, университеты.
Модуль наследственных заболеваний
Позволяет находить мутации и предоставлять статистические оценки развития заболеваний. Пользователи – академические организации, организации экспериментальной медицины, клиники пренатального генетического тестирования, а также страховые компании и индивидуальные потребители
Онко-модуль
Интерпретирует найденные мутации в опухоли и/или крови, помогает врачам уточнить диагноз и назначить таргетную терапию онкологическим пациентам, а также оптимизировать курс лечения. Модуль будет расширен до специализации по другим онкологическим заболеваниям. Пользователи – онкологические клиники, организации экспериментальной медицины.
Модуль преимплантационной диагностики
Позволяет выявить анеуплоидии и другие хромосомные перестройки в образцах при секвенировании полногеномной ДНК с низким покрытием.
Пользователи – клиники, оказывающие услуги пренатальной/преимплантационной диагностики и ЭКО.
Метагеномный модуль
Определяет состав бактерий и вирусов в образце слюны, почвы, пищи, и предоставляет информацию о степени их патогенности.
Пользователи – мониторинговые организации и BioTech-компании.
В разработке
Модуль оценки рисков заболеваний
Дает качественные статистические оценки развития заболеваний и предсказывает физиологические свойства обладателя генома. Пользователи D2C – “развлекательный” сегмент для индивидуальных потребителей. B2B пользователи – страховые компании и государственная система здравоохранения.
В разработке
Модуль фармакогенетики
Отображает список лекарственных препаратов, противопоказанных носителю данных геномных полиморфизмов.
Пользователи – индивидуальные потребители, аптеки, государственная система здравоохранения.
В разработке
Если имеющийся функционал и модули не подходят под ваши задачи, мы всегда открыты для сотрудничества. Наши программисты и биоинформатики готовы разработать индивидуальные пайплайны для работы с вашими данными.
Новости
16/05/22
Основные обновления в NGSWizard версии 1.8.0
- Существенно обновлен пайплайн обработки. Он теперь работает быстрее и точнее.
08/10/21
Минобрнауки нсо поддерживает развитие платформы genomenal
Новый модуль платформы Genomenal для оценки полигенных рисков распространенных заболеваний будет разработан в рамках
22/09/21
Genomenal в рейтинге toп-46 лучших стартапов и компаний в области больших данных в россии
Британское издание Data Magazine, принадлежащее лондонской медиакомпании Fupping LTD, на базе информации из Crunchbas
21/08/21
Обновление приложения NGS WIZARD 1.5.1
Выпущена новая версия инструмента для обработки данных секвенирования и медицинской генетики NGS Wizard 1.5.1.
Часто задаваемые вопросы
В чем преимущество NGS Wizard?
Русскоязычный интерфейс, современные пайплайны и инструменты, подробные детали работы пайплайна обработки данных. Возможность специализированной обработки и создания отчетов для различных нозологий, в отличие от универсальных программ. Программа обработки запускается самостоятельно и выдает результат, не нужно запускать и контролировать каждый шаг.
Долго ли занимает процесс установки программы?
Программа доступна в облаке и не требует установки, необходимо только создание аккаунта. В случае развертывания на серверах клиента процесс может занимать от нескольких часов, в зависимости от объема Ваших данных.
Нужны ли глубокие знания по биоинформатике для работы с NGS Wizard?
Для работы с NGS Wizard не требуется дополнительной квалификации - программой может пользоваться любой врач, студент, специалист без опыта в медицинской генетике.
Данные каких секвенаторов можно обрабатывать в NGS Wizard?
Сейчас можно обрабатывать данные, полученные на оборудовании Illumina и BGI/MGI. NGS Wizard не привязан к определенной платформе и в дальнейшем будет обрабатывать данные других секвенаторов.
В каком формате можно загружать данные, и нужно ли их предварительно обрабатывать?
Можно загрузить прочтения непосредственно из секвенатора в формате FASTQ, картирования в форматах SAM/BAM или генетические варианты в формате VCF, без дополнительной обработки.
Можно ли создавать собственные пайплайны обработки данных?
Сейчас есть возможность конфигурировать и настраивать существующие пайплайны непосредственно в среде NGS Wizard, но мы с радостью реализуем Ваш собственный пайплайн в виде эксклюзивного или общедоступного модуля.
Существуют ли в NGS Wizard пайплайны обработки экспериментов RNA-seq и других видов анализа генетического материала?
В настоящий момент поддерживаются пайплайны обработки соматических и герминальных точечных вариантов (SNV), инделов (indels), изменения числа копий (CNV) и структурных вариаций генома (SV), однако, мы готовы предложить создание нужных вам пайплайнов в короткие сроки.
Можно ли анализировать большие потоки образцов в автоматическом режиме?
Количество одновременно обрабатываемых образцов лимитировано только доступными вычислительными мощностями, а настроенный процесс автоматической биоинформатической обработки может применяться к любой серии образцов в автоматическом режиме.
Можно ли подробнее ознакомиться с NGS Wizard и передать свои пожелания?
Да, полностью функциональная пробная версия NGS Wizard предоставляется бесплатно и мы с радостью учтем ваши пожелания в развитии платформы. Кроме того, по запросу мы проведем детальную презентацию платформы и ответим на все вопросы.
Сколько стоит NGS Wizard?
Обработка геномных данных с помощью NGS Wizard возможна как онлайн (в облаке), так и на сервере клиента. Мы предлагаем гибкие варианты для разных задач наших партнеров.
Анализ данных секвенирования в облаке
Другие виды лицензии
Академическая лицензия для российских научных и образовательных организаций предоставляется бесплатно на ограниченный период времени.
Установка в периметр организации программного обеспечения NGS Wizard для работы с геномными данными
Novel Software Systems (NOVEL)
Genomenal - это платформа, которая включает в себя высокотехнологичный софт нового поколения для обработки геномных данных NGS Wizard, инструменты компьютерного зрения для анализа МРТ, КТ, изображений с электронных микроскопов и рентгенографии Bormental, приложение для предсказания функциональных доменов в аминокислотных последовательностях Protomenal, метод на основе нейросетей для моделирования эффекта воздействия веществ и терапии на гетерогенные опухоли iCanTreat. Платформа Genomenal является флагманской разработкой компании Novel Software Systems.
Новосибирск
630090, пр-т Академика Лаврентьева, 6,
офис 222
630090, пр-т Академика Лаврентьева, 6,
офис 222